Bactériens secondaires et les infections fongiques ont menacé les patients hospitalisés pendant des décennies et devenir plus urgents pendant que les agents pathogènes développent la résistance aux antibiotiques communs. Récemment, le centres pour le contrôle et la prévention des maladies a confirmé ce qui beaucoup de travailleurs et d'épidémiologues de ligne du front déjà suspectés : la pandémie COVID-19 a mené aux reculs « effrayants » dans le combat global contre la résistance antimicrobienne (Amr). Les infections résistant à la drogue dans les patients hospitalisés ont augmenté 15% à partir de 2019 à 2020.
Toutes les fois qu'un patient est hospitalisé pendant une période prolongée, ils deviennent de plus en plus vulnérables aux infections hôpital-acquises. L'exposition pathogène fortement infectieuse peut se produire des opérations standard suivantes exécutées avec un cathéter ou un ventilateur ou par l'intermédiaire de la diffusion de transmission dans l'unité de soins intensifs (ICU).
La situation devient plus compliquée quand les professionnels médicaux ne peuvent pas sûrement diagnostiquer le potentiel pour les menace-antibiotiques secondaires peuvent être administrés inutilement ou pour plus long que les agents pathogènes résistant à la drogue de nécessaire-exacerbation. Avec des avances dans des méthodes d'essai diagnostiques moléculaires, compter sur seuls des résultats de culture pour prendre des décisions concernant des soins aux patients antibiotiques d'utiliser-et n'est plus à approche appropriée.
Là où la culture fait défaut
Les méthodes d'essai conventionnelles de culture ont démontré des défis de sensibilité quand utilisé sur des patients prenant des antibiotiques (The Lancet, DOI : 10.1016/S2213- 2600(22) 00086-8). Même avec l'avertissement établi de documentation de ses pièges, des essais de culture sont largement acceptés comme niveau de soins pour identifier la présence des agents pathogènes et leur susceptibilité aux antibiotiques.
L'approche typique pour examiner un patient subissant un hôpital à long terme ou le séjour d'ICU implique de réaliser des essais de culture à intervalles multiples pendant l'hospitalisation. Les cliniciens emploient ces résultats pour identifier les agents pathogènes bactériens et fongiques et pour informer l'utilisation antibiotique. Ces résultats peuvent prendre plusieurs jours, incitant l'administration empirique des antibiotiques de large-spectre avant d'atteindre un diagnostic officiel.
Quand des essais de culture sont réalisés plus tard dans le séjour de l'hôpital du patient, les cliniciens recherchent la présence ou l'émergence continue des agents pathogènes pour évaluer si le cours antibiotique actuel de traitement fonctionne. Cependant, les défis de sensibilité inhérents avec la culture devraient appeler ces résultats dans la question, en particulier pour les patients qui ont été sur des antibiotiques pendant un temps prolongé.
Quand les cliniciens commande l'essai diagnostique moléculaire pour les mêmes échantillons patients, les résultats sont souvent empilés contre des résultats de culture. Par exemple, si les diagnostics moléculaires détectent un agent pathogène non vu dans un échantillon de culture, les résultats sont vus comme faux positif. Alternativement, si les diagnostics moléculaires n'identifiaient pas un agent pathogène détecté dans la culture, ceci constituerait un faux négatif.
Se trouve là le dilemme pour des membres du personnel soignant : Des résultats-souvent l'essai diagnostiques moléculaires a-t-il livré sensiblement plus rapidement que peut-il culture-est fait confiance pour fournir des informations diagnostiques fiables et pour informer des changements des décisions antibiotiques ?
Conclusion de la confiance en diagnostics moléculaires
Les études nombreuses ont confirmé la fiabilité et la valeur clinique des panneaux diagnostiques moléculaires rapides et complets pour identifier des agents pathogènes et des marqueurs d'Amr d'appareil urinaire respiratoire et, et d'échantillons de circulation sanguine.
Une étude récente à l'hôpital d'université de Karolinska a analysé les échantillons microbiologiques périodiques de culture prélevés des patients hospitalisés de pneumonie de COVID (journal européen de microbiologie et de maladies infectieuses cliniques, DOI : 10.1007/s10096-022-04466-9). Chaque échantillon respiratoire envoyé pour la culture a été également examiné utilisant un panneau diagnostique moléculaire multiplex de l'amplification en chaîne par réaction (ACP) pour comparer la progression de la détection d'agent pathogène à travers les deux méthodes.
Le prélèvement des échantillons périodiques provenant d'un patient différents jours offre une approche plus complète que comparant une culture simple et un échantillon moléculaire correspondant provenant d'un jour. Utilisant les échantillons périodiques, le panneau multiplex d'ACP a détecté des agents pathogènes, y compris Staphylococcus aureus et le streptocoque pneumoniae, meilleurs que la culture dans la plupart des cas. Par conséquent, les chercheurs ont conclu que les résultats du jury d'ACP devraient être considérés les positifs vrais quand ces mêmes agents pathogènes ont été confirmés dans les cultures suivantes. Ces résultats devraient renforcer la confiance en fiabilité des diagnostics moléculaires rapides.
Compter sur les panneaux diagnostiques multiplex pour de premiers et complets résultats patients a également des implications pour l'intendance antibiotique et abaisser la charge des infections d'Amr à travers des dispensaires. Des patients de Karolinska pour qui l'ACP a détecté un agent pathogène supplémentaire, 71,4% ont été exposés aux antibiotiques avant la collection témoin. Nous devons reconnaître l'impact défavorable connu des ces thérapeutique sur des résultats microbiologiques de culture et encourager des cliniciens à se tourner vers les panneaux diagnostiques moléculaires comme nouveau niveau de soins.
L'essai d'ACP devrait se produire plus tôt dans le séjour de l'hôpital d'un patient. La confiance accrue en et l'accès à ces panneaux réduiront utiliser-et antibiotique inutile, par extension, infection inférieure et débits de transmission pour les patients sévèrement malades subissant des hospitalisations prolongées. Il aidera également à améliorer l'intendance antibiotique au fil du temps.
Oliver Schacht est le Président d'OpGen, Inc., une médecine pilote de précision, une bio-informatique, et société genomic d'analyse fournissant les solutions complètes pour des patients, des hôpitaux, et des décisions à l'ensemble du réseau de prévention et de traitement d'infection.
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